Plant protein-protein interaction sites

Experimental PPI: A4IJ27-P92978  (Homology Modeling of Protein Complex)


Organism: Arabidopsis thaliana


Uniprot IDGene IDGene name Template|chainRange SeqId Coverage Description
A4IJ27 827967ROPGEF3 2nty | B 103-4730.49 0.78Rop guanine nucleotide exchange factor 3
P92978 824293ARAC11 2nty | C 4-1790.92 0.91Rac-like GTP-binding protein ARAC11

Interaction partners in intraspecies PPI networkView



Target-Template Alignment


A4IJ27 Target-Template Alignment


P92978 Target-Template Alignment



3D Structure  Download


Style: 
Color: 

PPI Site  Show Clear All


Visible A4IJ27   P92978   Interaction force type ΔΔG  ΔΔG  ConservationConservation
 GLN 185THR 162Van der Waals 0.46-1.45-0.64 -0.65 
 GLN 185GLU 164Van der Waals 0.46-5.12-0.64 1.52 
 GLN 185GLN 163Van der Waals 0.461.14-0.64 -0.45 
 PHE 180VAL 47Van der Waals 0.32-0.81-0.44 -0.25 
 PHE 180TYR 26Van der Waals 0.32-0.89-0.44 -0.93 
 PHE 180ALA 45Van der Waals 0.32-0.03-0.44 -0.27 
 PHE 180ASN 46Van der Waals 0.320.01-0.44 -0.04 
 MET 196TYR 26Van der Waals -1.26-0.89-0.68 -0.93 
 MET 196ASP 171Van der Waals -1.26-1.68-0.68 -0.55 
 MET 196ASN 29Van der Waals -1.260.84-0.68 -0.85 
 ALA 191LEU 120Van der Waals 0.010.35-0.27 0.52 
 ALA 191GLU 164Van der Waals 0.01-5.12-0.27 1.52 
 ALA 191ASN 165Van der Waals 0.010.29-0.27 -0.27 
 PRO 182LYS 167Van der Waals 0.51-7.70-0.20 -0.66 
 GLY 190GLU 164Van der Waals -0.01-5.12-0.80 1.52 
 VAL 193GLU 164Van der Waals -2.37-5.120.16 1.52 
 VAL 193GLN 163Van der Waals -2.371.140.16 -0.45 
 VAL 193VAL 166Van der Waals -2.370.390.16 0.54 
 VAL 193ASN 165Van der Waals -2.370.290.16 -0.27 
 VAL 193ALA 168Van der Waals -2.37-0.050.16 1.22 
 VAL 193LYS 167Van der Waals -2.37-7.700.16 -0.66 
 VAL 195TYR 26Van der Waals 0.94-0.890.81 -0.93 
 VAL 195ASN 29Van der Waals 0.940.840.81 -0.85 
 VAL 195LYS 167Van der Waals 0.94-7.700.81 -0.66 
 THR 192GLU 164Van der Waals 0.08-5.121.01 1.52 
 THR 192ASN 165Van der Waals 0.080.291.01 -0.27 
 LEU 187THR 162Van der Waals -0.91-1.45-0.80 -0.65 
 LEU 187GLU 164Van der Waals -0.91-5.12-0.80 1.52 
 GLU 194VAL 166Van der Waals -6.500.39-0.59 0.54 
 GLU 194ASP 171Van der Waals -6.50-1.68-0.59 -0.55 
 GLU 194ALA 168Van der Waals -6.50-0.05-0.59 1.22 
 GLU 194LYS 167Van der Waals|Electrostatic bond -6.50-7.70-0.59 -0.66 
 ARG 183LYS 167Van der Waals 0.01-7.700.11 -0.66 
 ASN 189GLU 164Van der Waals 0.21-5.120.10 1.52 


Copyright © 2021 Ziding Zhang's Lab - China Agricultural University. All Rights Reserved. Maintained by Xiaodi Yang   京ICP备18035355号